Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms