Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Top3bQ9Z321 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Top3bQ9Z321 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms