Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsf13bQ9WU72 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms