Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms