Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Snai3Q9QY31 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Snai3Q9QY31 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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