Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms