Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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