Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capn12Q9ER56 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Capn12Q9ER56 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capn12Q9ER56 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms