Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PudpQ9D5U5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PudpQ9D5U5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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