Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CYI0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CYI0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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