Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Khdc3Q9CWU5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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