Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Med28Q920D3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms