Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms