Protein–RNA interactions for Protein: Q8K485

Kctd11, BTB/POZ domain-containing protein KCTD11, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd11Q8K485 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Kctd11Q8K485 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms