Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
Gm9955Q8CEJ8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms