Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrebrfQ8CDG5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrebrfQ8CDG5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms