Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm16223Q8CBM3 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm16223Q8CBM3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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