Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ctdsp2Q8BX07 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ctdsp2Q8BX07 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Ctdsp2Q8BX07 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ctdsp2Q8BX07 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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