Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Actn1Q7TPR4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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