Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms