Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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