Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc34Q3UI66 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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