Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfaip8l3Q3TBL6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms