Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Samd11Q1RNF8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Samd11Q1RNF8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms