Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ctnnb1Q02248 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms