Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Otx1P80205 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms