Protein–RNA interactions for Protein: P62196

Psmc5, 26S proteasome regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc5P62196 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmc5P62196 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms