Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp5P56399 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms