Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad23aP54726 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad23aP54726 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad23aP54726 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad23aP54726 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad23aP54726 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms