Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp3P49194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms