Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp4P35123 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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