Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifnar1P33896 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifnar1P33896 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms