Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a1P19437 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms