Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RargP18911 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RargP18911 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RargP18911 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RargP18911 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RargP18911 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms