Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Barx2O08686 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms