Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Efna3O08545 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Efna3O08545 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms