Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fndc1E9Q043 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms