Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn8Q9Z260 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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