Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ilf3Q9Z1X4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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