Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ArcQ9WV31 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms