Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp1a4Q9WV27 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms