Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Limd1Q9QXD8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Limd1Q9QXD8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms