Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmod4Q9JLH8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Tmod4Q9JLH8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmod4Q9JLH8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tmod4Q9JLH8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms