Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Upk3aQ9JKX8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Upk3aQ9JKX8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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