Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gpa33Q9JKA5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gpa33Q9JKA5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms