Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tuba8Q9JJZ2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Tuba8Q9JJZ2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Tuba8Q9JJZ2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tuba8Q9JJZ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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