Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms