Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Shisa9Q9CZN4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Shisa9Q9CZN4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Shisa9Q9CZN4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Shisa9Q9CZN4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Shisa9Q9CZN4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Shisa9Q9CZN4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms