Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Atg12Q9CQY1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Atg12Q9CQY1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms