Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Prpf8Q99PV0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms